24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2442 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2442  Protein of unknown function DUF1826  100 
 
 		 215 aa  437  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4535  hypothetical protein  34.76 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6336  hypothetical protein  35.55 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73000  hypothetical protein  34.15 
 
 		 213 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000544841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5654  hypothetical protein  33.02 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0460774 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02121  hypothetical protein  27.41 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0929  hypothetical protein  30.46 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1979  hypothetical protein  27.6 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.246592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5074  hypothetical protein  30.93 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5525  hypothetical protein  33.87 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5268  hypothetical protein  29.63 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484501 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0300  hypothetical protein  26.34 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.800671  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5409  hypothetical protein  31.4 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800973 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5360  hypothetical protein  29.63 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2253  hypothetical protein  29.76 
 
 		 211 aa  72  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1816  hypothetical protein  27.32 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2486  hypothetical protein  34.21 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1339  hypothetical protein  31.05 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22990  hypothetical protein  36.07 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2320  hypothetical protein  28.71 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.162921  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5138  hypothetical protein  29.46 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.443153 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2593  hypothetical protein  32.31 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636867 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1319  Protein of unknown function DUF1826  29.3 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18357  predicted protein  28.47 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.694744  normal  0.0428504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>