27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0947 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0947  putative lipoprotein  100 
 
 		 275 aa  567  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3203  hypothetical protein  47.47 
 
 		 266 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.637213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3270  hypothetical protein  46.69 
 
 		 266 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.457335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3370  putative inner membrane protein  46.69 
 
 		 266 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3191  putative inner membrane protein  46.39 
 
 		 266 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1841  putative lipoprotein  41.6 
 
 		 264 aa  225  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2285  putative lipoprotein  41.6 
 
 		 264 aa  224  8e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1951  hypothetical protein  41.22 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2289  hypothetical protein  49.75 
 
 		 220 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.870625  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3420  hypothetical protein  49.5 
 
 		 559 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3483  hypothetical protein  49.5 
 
 		 559 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0351251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1409  hypothetical protein  37.5 
 
 		 281 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0211733  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1360  hypothetical protein  45 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3431  hypothetical protein  47.78 
 
 		 559 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574576  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4377  hypothetical protein  41.92 
 
 		 258 aa  203  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6651  hypothetical protein  41.18 
 
 		 283 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000122053 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4863  hypothetical protein  42.31 
 
 		 266 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  hitchhiker  0.000146739 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4347  hypothetical protein  42.36 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000585573 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4429  hypothetical protein  28.57 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0456989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2759  protein of unknown function DUF1460  28.87 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54702 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3317  hypothetical protein  24.79 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0607  hypothetical protein  27.64 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0624  hypothetical protein  27.34 
 
 		 356 aa  68.6  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2885  protein of unknown function DUF1460  28.81 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4185  protein of unknown function DUF1460  25.26 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4224  protein of unknown function DUF1460  25.26 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.10408  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5704  oligopeptide transporter, OPT family  23.33 
 
 		 688 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.525123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>