27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3270 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3270  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  553  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.457335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3370  putative inner membrane protein  99.25 
 
 		 266 aa  550  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3191  putative inner membrane protein  99.25 
 
 		 266 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3203  hypothetical protein  98.12 
 
 		 266 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.637213 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0947  putative lipoprotein  46.69 
 
 		 275 aa  259  3e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1951  hypothetical protein  45.91 
 
 		 264 aa  249  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2285  putative lipoprotein  45.53 
 
 		 264 aa  248  5e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1841  putative lipoprotein  45.53 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1409  hypothetical protein  42.14 
 
 		 281 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0211733  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1360  hypothetical protein  43.8 
 
 		 278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2289  hypothetical protein  49.51 
 
 		 220 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.870625  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4377  hypothetical protein  46.52 
 
 		 258 aa  211  9e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3483  hypothetical protein  50.98 
 
 		 559 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0351251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3420  hypothetical protein  50.98 
 
 		 559 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3431  hypothetical protein  50.49 
 
 		 559 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574576  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6651  hypothetical protein  39.78 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000122053 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4347  hypothetical protein  46.41 
 
 		 301 aa  194  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000585573 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4863  hypothetical protein  46.89 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  hitchhiker  0.000146739 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2759  protein of unknown function DUF1460  31.62 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4429  hypothetical protein  29.76 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0456989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4224  protein of unknown function DUF1460  25.11 
 
 		 310 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.10408  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2885  protein of unknown function DUF1460  28.28 
 
 		 289 aa  72  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4185  protein of unknown function DUF1460  25.11 
 
 		 310 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3317  hypothetical protein  23.36 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0624  hypothetical protein  26.51 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0607  hypothetical protein  26.51 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2334  protein of unknown function DUF1460  24.83 
 
 		 277 aa  48.9  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>