26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4429 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4429  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  852    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0456989  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4224  protein of unknown function DUF1460  52.59 
 
 
310 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.10408  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4185  protein of unknown function DUF1460  52.59 
 
 
310 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2334  protein of unknown function DUF1460  43.35 
 
 
277 aa  236  4e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2759  protein of unknown function DUF1460  35.4 
 
 
272 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.54702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2885  protein of unknown function DUF1460  33.47 
 
 
289 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261139  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3191  putative inner membrane protein  29.76 
 
 
266 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3203  hypothetical protein  29.76 
 
 
266 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.637213 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3370  putative inner membrane protein  29.76 
 
 
266 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367561  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3270  hypothetical protein  29.76 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.457335  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0947  putative lipoprotein  28.57 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6651  hypothetical protein  24.71 
 
 
283 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000122053 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1360  hypothetical protein  25.77 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1951  hypothetical protein  25.98 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2285  putative lipoprotein  25.62 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1409  hypothetical protein  24.89 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0211733  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2289  hypothetical protein  27.35 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.870625  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1841  putative lipoprotein  25.62 
 
 
264 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4347  hypothetical protein  22.32 
 
 
301 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000585573 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4863  hypothetical protein  22.32 
 
 
266 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  hitchhiker  0.000146739 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3431  hypothetical protein  25.13 
 
 
559 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574576  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3483  hypothetical protein  25.63 
 
 
559 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0351251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3420  hypothetical protein  25.63 
 
 
559 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4377  hypothetical protein  25.9 
 
 
258 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130832  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0607  hypothetical protein  24.77 
 
 
356 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0624  hypothetical protein  24.31 
 
 
356 aa  53.1  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>