27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6651 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6651  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000122053 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4347  hypothetical protein  77.22 
 
 
301 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000585573 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4863  hypothetical protein  77.04 
 
 
266 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  hitchhiker  0.000146739 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1951  hypothetical protein  53.82 
 
 
264 aa  310  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2285  putative lipoprotein  53.45 
 
 
264 aa  310  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1360  hypothetical protein  53.07 
 
 
278 aa  310  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1841  putative lipoprotein  53.45 
 
 
264 aa  308  5.9999999999999995e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1409  hypothetical protein  53.24 
 
 
281 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0211733  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3483  hypothetical protein  49.22 
 
 
559 aa  255  6e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0351251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3420  hypothetical protein  49.22 
 
 
559 aa  255  6e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3431  hypothetical protein  48.84 
 
 
559 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574576  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4377  hypothetical protein  50.2 
 
 
258 aa  248  7e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130832  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2289  hypothetical protein  54.37 
 
 
220 aa  238  8e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.870625  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3191  putative inner membrane protein  40.15 
 
 
266 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3203  hypothetical protein  39.42 
 
 
266 aa  205  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.637213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3270  hypothetical protein  39.78 
 
 
266 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.457335  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3370  putative inner membrane protein  39.78 
 
 
266 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367561  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0947  putative lipoprotein  41.18 
 
 
275 aa  193  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4185  protein of unknown function DUF1460  27.62 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4224  protein of unknown function DUF1460  27.62 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.10408  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4429  hypothetical protein  24.71 
 
 
414 aa  79  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0456989  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2885  protein of unknown function DUF1460  31.51 
 
 
289 aa  79  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261139  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2759  protein of unknown function DUF1460  27.78 
 
 
272 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.54702 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2334  protein of unknown function DUF1460  26.1 
 
 
277 aa  62.8  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3317  hypothetical protein  23.81 
 
 
312 aa  48.9  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0607  hypothetical protein  23.66 
 
 
356 aa  42.7  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0624  hypothetical protein  23.79 
 
 
356 aa  42  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>