27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4347 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4347  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  620  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000585573 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4863  hypothetical protein  95.49 
 
 		 266 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  hitchhiker  0.000146739 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6651  hypothetical protein  77.22 
 
 		 283 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000122053 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1951  hypothetical protein  52.03 
 
 		 264 aa  300  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2285  putative lipoprotein  51.66 
 
 		 264 aa  300  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1841  putative lipoprotein  51.66 
 
 		 264 aa  298  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1360  hypothetical protein  50.72 
 
 		 278 aa  288  7e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1409  hypothetical protein  53.56 
 
 		 281 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0211733  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4377  hypothetical protein  48.13 
 
 		 258 aa  244  9e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3420  hypothetical protein  50.66 
 
 		 559 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3483  hypothetical protein  50.66 
 
 		 559 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0351251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2289  hypothetical protein  53.88 
 
 		 220 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.870625  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3431  hypothetical protein  50.22 
 
 		 559 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574576  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3203  hypothetical protein  46.41 
 
 		 266 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.637213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3191  putative inner membrane protein  46.89 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3270  hypothetical protein  46.41 
 
 		 266 aa  195  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.457335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3370  putative inner membrane protein  46.41 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0947  putative lipoprotein  38.11 
 
 		 275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2759  protein of unknown function DUF1460  29.46 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2885  protein of unknown function DUF1460  31.06 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4185  protein of unknown function DUF1460  25.75 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4224  protein of unknown function DUF1460  25.75 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.10408  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4429  hypothetical protein  21.92 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0456989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2334  protein of unknown function DUF1460  28.51 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3317  hypothetical protein  24.8 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0624  hypothetical protein  24.73 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0607  hypothetical protein  24.1 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>