27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2285 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2285  putative lipoprotein  100 
 
 
264 aa  541  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1951  hypothetical protein  98.86 
 
 
264 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1841  putative lipoprotein  98.48 
 
 
264 aa  535  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6651  hypothetical protein  53.45 
 
 
283 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000122053 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1360  hypothetical protein  53.43 
 
 
278 aa  306  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4347  hypothetical protein  52.04 
 
 
301 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000585573 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4863  hypothetical protein  60.09 
 
 
266 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  hitchhiker  0.000146739 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1409  hypothetical protein  48.55 
 
 
281 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0211733  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2289  hypothetical protein  52.05 
 
 
220 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.870625  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3203  hypothetical protein  46.3 
 
 
266 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.637213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3191  putative inner membrane protein  44.87 
 
 
266 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3270  hypothetical protein  45.53 
 
 
266 aa  248  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.457335  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3370  putative inner membrane protein  45.53 
 
 
266 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367561  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4377  hypothetical protein  45.7 
 
 
258 aa  246  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130832  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3483  hypothetical protein  52.45 
 
 
559 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0351251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3420  hypothetical protein  52.45 
 
 
559 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3431  hypothetical protein  52.45 
 
 
559 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574576  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0947  putative lipoprotein  41.6 
 
 
275 aa  224  8e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4185  protein of unknown function DUF1460  31.65 
 
 
310 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4224  protein of unknown function DUF1460  31.65 
 
 
310 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.10408  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2759  protein of unknown function DUF1460  29.49 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.54702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4429  hypothetical protein  25.62 
 
 
414 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0456989  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2885  protein of unknown function DUF1460  29.31 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261139  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2334  protein of unknown function DUF1460  24.69 
 
 
277 aa  55.8  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0607  hypothetical protein  27.49 
 
 
356 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0624  hypothetical protein  28.79 
 
 
356 aa  45.8  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3317  hypothetical protein  23.23 
 
 
312 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.959668 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>