39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0219 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0219  putative lipoprotein  100 
 
 		 113 aa  231  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00987  hypothetical protein  70.33 
 
 		 113 aa  143  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004411  hypothetical protein  68.89 
 
 		 113 aa  138  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2754  hypothetical protein  28.32 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143193  normal  0.0149578 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1072  conserved hypothetical protein  28.32 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0142989  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02455  hypothetical protein  28.32 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.323286  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3841  hypothetical protein  28.32 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1081  hypothetical protein  28.32 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0564666  hitchhiker  0.000305939 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2886  hypothetical protein  28.32 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0391507  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02491  hypothetical protein  28.32 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3150  hypothetical protein  30.36 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2989  hypothetical protein  30.43 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0255243  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2759  hypothetical protein  28.18 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000835902  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1129  hypothetical protein  30.36 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001153  hypothetical protein  28.57 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000282051  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3081  hypothetical protein  30.23 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.896798  normal  0.0577193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0675  hypothetical protein  27.36 
 
 		 184 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1340  putative lipoprotein  29.82 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.6612  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0370  hypothetical protein  35.35 
 
 		 181 aa  50.8  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0444875  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01314  hypothetical protein  28.07 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0754  hypothetical protein  31 
 
 		 211 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3974  hypothetical protein  29.17 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1368  hypothetical protein  26.32 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0390  hypothetical protein  30.43 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189667  unclonable  0.000000000389421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0705  hypothetical protein  28.87 
 
 		 182 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3360  hypothetical protein  26.88 
 
 		 182 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0662  hypothetical protein  26.88 
 
 		 182 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.382195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3679  hypothetical protein  25.51 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0695  hypothetical protein  25.51 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0705  hypothetical protein  25.51 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0674  hypothetical protein  25.51 
 
 		 182 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06628  hypothetical protein  28.89 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0661  hypothetical protein  27.08 
 
 		 194 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.109092 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2856  hypothetical protein  30.1 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00782  hypothetical protein  28.07 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1341  putative lipoprotein  24.11 
 
 		 119 aa  43.5  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1350  putative lipoprotein  29.66 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1903  hypothetical protein  30.3 
 
 		 181 aa  42.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153318  normal  0.201285 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001691  hypothetical protein  30.77 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>