17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2856 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2856  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  265  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1129  hypothetical protein  51.4 
 
 
115 aa  122  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3150  hypothetical protein  50.94 
 
 
115 aa  122  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0996  hypothetical protein  49.04 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.116677  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3081  hypothetical protein  39.05 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.896798  normal  0.0577193 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2989  hypothetical protein  35.54 
 
 
121 aa  79.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0255243  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1072  conserved hypothetical protein  34.71 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0142989  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2886  hypothetical protein  34.71 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0391507  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1081  hypothetical protein  34.71 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0564666  hitchhiker  0.000305939 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02491  hypothetical protein  34.71 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3841  hypothetical protein  34.71 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122753  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02455  hypothetical protein  34.71 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.323286  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2754  hypothetical protein  33.88 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143193  normal  0.0149578 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2759  hypothetical protein  34.48 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000835902  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0219  putative lipoprotein  30.1 
 
 
113 aa  44.7  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004411  hypothetical protein  33.75 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00987  hypothetical protein  32.5 
 
 
113 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>