19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2989 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2989  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  254  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0255243  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1072  conserved hypothetical protein  98.35 
 
 		 121 aa  251  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0142989  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02455  hypothetical protein  98.35 
 
 		 121 aa  251  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.323286  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02491  hypothetical protein  98.35 
 
 		 121 aa  251  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1081  hypothetical protein  98.35 
 
 		 121 aa  251  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0564666  hitchhiker  0.000305939 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2886  hypothetical protein  98.35 
 
 		 121 aa  251  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0391507  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2754  hypothetical protein  97.52 
 
 		 121 aa  249  7e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143193  normal  0.0149578 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3841  hypothetical protein  97.52 
 
 		 121 aa  249  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2759  hypothetical protein  97.3 
 
 		 116 aa  229  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000835902  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3081  hypothetical protein  50 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.896798  normal  0.0577193 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3150  hypothetical protein  41.35 
 
 		 115 aa  81.3  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1129  hypothetical protein  39.29 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2856  hypothetical protein  35.54 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0996  hypothetical protein  39.13 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.116677  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0219  putative lipoprotein  30.43 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00987  hypothetical protein  35.63 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1340  putative lipoprotein  30.48 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.6612  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004411  hypothetical protein  30.68 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0675  hypothetical protein  27.93 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>