19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2759 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2759  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  244  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000835902  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3841  hypothetical protein  99.1 
 
 
121 aa  233  6e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122753  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1072  conserved hypothetical protein  99.1 
 
 
121 aa  233  7e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0142989  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02455  hypothetical protein  99.1 
 
 
121 aa  233  7e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.323286  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02491  hypothetical protein  99.1 
 
 
121 aa  233  7e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2886  hypothetical protein  99.1 
 
 
121 aa  233  7e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0391507  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1081  hypothetical protein  99.1 
 
 
121 aa  233  7e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0564666  hitchhiker  0.000305939 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2754  hypothetical protein  98.2 
 
 
121 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143193  normal  0.0149578 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2989  hypothetical protein  97.3 
 
 
121 aa  229  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0255243  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3081  hypothetical protein  50.88 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.896798  normal  0.0577193 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3150  hypothetical protein  40.57 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1129  hypothetical protein  36.84 
 
 
115 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2856  hypothetical protein  34.48 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0996  hypothetical protein  37.84 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.116677  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0219  putative lipoprotein  28.18 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00987  hypothetical protein  34.15 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004411  hypothetical protein  30.59 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1340  putative lipoprotein  29.91 
 
 
119 aa  50.8  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.6612  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0675  hypothetical protein  27.93 
 
 
184 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>