19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2886 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1072  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  255  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0142989  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02455  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  255  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.323286  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02491  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  255  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1081  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  255  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0564666  hitchhiker  0.000305939 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2886  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  255  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0391507  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2754  hypothetical protein  99.17 
 
 		 121 aa  253  4e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143193  normal  0.0149578 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3841  hypothetical protein  99.17 
 
 		 121 aa  253  7e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2989  hypothetical protein  98.35 
 
 		 121 aa  251  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0255243  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2759  hypothetical protein  99.1 
 
 		 116 aa  233  7e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000835902  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3081  hypothetical protein  50.81 
 
 		 124 aa  123  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.896798  normal  0.0577193 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3150  hypothetical protein  41.35 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2856  hypothetical protein  34.71 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1129  hypothetical protein  37.5 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0996  hypothetical protein  38.26 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.116677  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0219  putative lipoprotein  28.32 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00987  hypothetical protein  34.12 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004411  hypothetical protein  30.68 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1340  putative lipoprotein  29.52 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.6612  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0675  hypothetical protein  27.93 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>