22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1340 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1340  putative lipoprotein  100 
 
 		 119 aa  247  5e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.6612  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1341  putative lipoprotein  43.7 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00782  hypothetical protein  44.92 
 
 		 119 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001691  hypothetical protein  43.22 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1350  putative lipoprotein  33.04 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2989  hypothetical protein  30.48 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0255243  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1072  conserved hypothetical protein  29.52 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0142989  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02455  hypothetical protein  29.52 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.323286  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3841  hypothetical protein  29.52 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1081  hypothetical protein  29.52 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0564666  hitchhiker  0.000305939 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2886  hypothetical protein  29.52 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0391507  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0219  putative lipoprotein  29.82 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02491  hypothetical protein  29.52 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2754  hypothetical protein  29.52 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143193  normal  0.0149578 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2759  hypothetical protein  29.91 
 
 		 116 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000835902  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1129  hypothetical protein  27.88 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3150  hypothetical protein  28.85 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0996  hypothetical protein  30.69 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.116677  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1368  hypothetical protein  24.49 
 
 		 145 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3081  hypothetical protein  26.92 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.896798  normal  0.0577193 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001153  hypothetical protein  29.7 
 
 		 170 aa  41.2  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000282051  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00987  hypothetical protein  36.62 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>