19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3150 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3150  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  244  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1129  hypothetical protein  88.7 
 
 		 115 aa  220  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0996  hypothetical protein  52.68 
 
 		 125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.116677  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2856  hypothetical protein  50.94 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3081  hypothetical protein  41.58 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.896798  normal  0.0577193 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2759  hypothetical protein  40.57 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000835902  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2989  hypothetical protein  41.35 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0255243  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1072  conserved hypothetical protein  41.35 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0142989  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2886  hypothetical protein  41.35 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0391507  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1081  hypothetical protein  41.35 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0564666  hitchhiker  0.000305939 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02491  hypothetical protein  41.35 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02455  hypothetical protein  41.35 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.323286  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3841  hypothetical protein  41.35 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2754  hypothetical protein  41.35 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143193  normal  0.0149578 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0219  putative lipoprotein  30.36 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1340  putative lipoprotein  28.85 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.6612  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00987  hypothetical protein  31.4 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004411  hypothetical protein  31.4 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01314  hypothetical protein  27.19 
 
 		 140 aa  43.5  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>