32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0675 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0675  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  383  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3974  hypothetical protein  49.43 
 
 		 182 aa  178  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0695  hypothetical protein  49.1 
 
 		 182 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0674  hypothetical protein  48.5 
 
 		 182 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3679  hypothetical protein  48.5 
 
 		 182 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0705  hypothetical protein  48.5 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0661  hypothetical protein  49.38 
 
 		 194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.109092 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0662  hypothetical protein  47.47 
 
 		 182 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.382195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3360  hypothetical protein  47.47 
 
 		 182 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0705  hypothetical protein  48.8 
 
 		 182 aa  156  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001153  hypothetical protein  35.19 
 
 		 170 aa  114  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000282051  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06628  hypothetical protein  36.11 
 
 		 151 aa  97.8  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1072  hypothetical protein  28.41 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.837571  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2913  hypothetical protein  25 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0370  hypothetical protein  29.69 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0444875  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0754  hypothetical protein  24.7 
 
 		 211 aa  67.8  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004411  hypothetical protein  36.59 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1903  hypothetical protein  32.29 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153318  normal  0.201285 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0219  putative lipoprotein  27.36 
 
 		 113 aa  51.6  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0390  hypothetical protein  28.81 
 
 		 163 aa  51.2  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189667  unclonable  0.000000000389421 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00987  hypothetical protein  32.56 
 
 		 113 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1368  hypothetical protein  28.87 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1341  putative lipoprotein  32.29 
 
 		 119 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1072  conserved hypothetical protein  27.93 
 
 		 121 aa  42.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0142989  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02455  hypothetical protein  27.93 
 
 		 121 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.323286  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3841  hypothetical protein  27.93 
 
 		 121 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2989  hypothetical protein  27.93 
 
 		 121 aa  42.4  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0255243  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1081  hypothetical protein  27.93 
 
 		 121 aa  42.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0564666  hitchhiker  0.000305939 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2886  hypothetical protein  27.93 
 
 		 121 aa  42.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0391507  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02491  hypothetical protein  27.93 
 
 		 121 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2759  hypothetical protein  27.93 
 
 		 116 aa  42.4  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000835902  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2754  hypothetical protein  27.03 
 
 		 121 aa  41.2  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143193  normal  0.0149578 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>