23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0661 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0661  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.109092 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3974  hypothetical protein  91.76 
 
 
182 aa  346  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0662  hypothetical protein  92.86 
 
 
182 aa  319  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.382195  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3360  hypothetical protein  92.86 
 
 
182 aa  319  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0705  hypothetical protein  78.57 
 
 
182 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3679  hypothetical protein  78.02 
 
 
182 aa  300  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0695  hypothetical protein  77.47 
 
 
182 aa  299  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0674  hypothetical protein  77.47 
 
 
182 aa  299  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0705  hypothetical protein  81.32 
 
 
182 aa  294  7e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0675  hypothetical protein  48.85 
 
 
184 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001153  hypothetical protein  40.82 
 
 
170 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000282051  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06628  hypothetical protein  40.24 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2913  hypothetical protein  29.76 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611181  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0370  hypothetical protein  34.48 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0444875  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0754  hypothetical protein  30.9 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1072  hypothetical protein  29.1 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.837571  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0390  hypothetical protein  32.17 
 
 
163 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189667  unclonable  0.000000000389421 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1903  hypothetical protein  29.84 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153318  normal  0.201285 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004411  hypothetical protein  30.49 
 
 
113 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00987  hypothetical protein  31.4 
 
 
113 aa  45.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0219  putative lipoprotein  27.08 
 
 
113 aa  45.4  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1368  hypothetical protein  25.51 
 
 
145 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1350  putative lipoprotein  31.58 
 
 
120 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>