22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06628 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06628  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  313  4e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001153  hypothetical protein  65.56 
 
 
170 aa  224  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000282051  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0695  hypothetical protein  39.02 
 
 
182 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3679  hypothetical protein  39.02 
 
 
182 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0705  hypothetical protein  39.02 
 
 
182 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3974  hypothetical protein  39.63 
 
 
182 aa  121  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0674  hypothetical protein  37.8 
 
 
182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0662  hypothetical protein  37.65 
 
 
182 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.382195  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3360  hypothetical protein  37.65 
 
 
182 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0661  hypothetical protein  42.14 
 
 
194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.109092 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0705  hypothetical protein  37.91 
 
 
182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0675  hypothetical protein  36.11 
 
 
184 aa  105  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0754  hypothetical protein  30 
 
 
211 aa  73.6  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1072  hypothetical protein  30.84 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.837571  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2913  hypothetical protein  28.17 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611181  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1903  hypothetical protein  32.11 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153318  normal  0.201285 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0390  hypothetical protein  31.19 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189667  unclonable  0.000000000389421 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0370  hypothetical protein  30.77 
 
 
181 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0444875  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00987  hypothetical protein  29.9 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1368  hypothetical protein  23.81 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004411  hypothetical protein  28.57 
 
 
113 aa  47.8  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0219  putative lipoprotein  30.68 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>