20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2913 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2913  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  430  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611181  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0754  hypothetical protein  34.22 
 
 
211 aa  99.8  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1072  hypothetical protein  38.18 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.837571  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0695  hypothetical protein  32.89 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3679  hypothetical protein  32.89 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0705  hypothetical protein  32.89 
 
 
182 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0661  hypothetical protein  30.49 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.109092 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0674  hypothetical protein  32.21 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001153  hypothetical protein  29.41 
 
 
170 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000282051  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3974  hypothetical protein  30.41 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3360  hypothetical protein  29.32 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0662  hypothetical protein  29.32 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.382195  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0675  hypothetical protein  25 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0370  hypothetical protein  26.32 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0444875  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0705  hypothetical protein  31.29 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06628  hypothetical protein  28.17 
 
 
151 aa  63.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1903  hypothetical protein  31.16 
 
 
181 aa  61.6  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153318  normal  0.201285 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0390  hypothetical protein  35.87 
 
 
163 aa  57  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189667  unclonable  0.000000000389421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  24.64 
 
 
690 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1806  hypothetical protein  27.71 
 
 
595 aa  42  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>