19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1072 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1072  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  409  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.837571  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0370  hypothetical protein  38.35 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0444875  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001153  hypothetical protein  34.13 
 
 		 170 aa  89.4  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000282051  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0754  hypothetical protein  43.4 
 
 		 211 aa  87.8  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2913  hypothetical protein  38.18 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0675  hypothetical protein  28.41 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0695  hypothetical protein  32.52 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3679  hypothetical protein  32.52 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0705  hypothetical protein  32.52 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3974  hypothetical protein  31.45 
 
 		 182 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0674  hypothetical protein  30.89 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1903  hypothetical protein  33.61 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153318  normal  0.201285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0661  hypothetical protein  29.1 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.109092 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06628  hypothetical protein  34.02 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0390  hypothetical protein  32.56 
 
 		 163 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189667  unclonable  0.000000000389421 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3360  hypothetical protein  32 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0662  hypothetical protein  32 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.382195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1368  hypothetical protein  32.38 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0705  hypothetical protein  32.43 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>