20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0754 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0754  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  423  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2913  hypothetical protein  34.22 
 
 
207 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611181  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0370  hypothetical protein  36.36 
 
 
181 aa  91.7  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0444875  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1072  hypothetical protein  43.4 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.837571  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001153  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  85.1  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000282051  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3679  hypothetical protein  28.82 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0695  hypothetical protein  28.82 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0705  hypothetical protein  28.82 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0674  hypothetical protein  28.24 
 
 
182 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3974  hypothetical protein  29.14 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0661  hypothetical protein  29.05 
 
 
194 aa  72  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.109092 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06628  hypothetical protein  29.14 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0675  hypothetical protein  24.7 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0662  hypothetical protein  28.93 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.382195  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3360  hypothetical protein  28.93 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0705  hypothetical protein  29.57 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1903  hypothetical protein  35 
 
 
181 aa  62.4  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153318  normal  0.201285 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0390  hypothetical protein  34.34 
 
 
163 aa  62.4  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189667  unclonable  0.000000000389421 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0219  putative lipoprotein  31 
 
 
113 aa  48.5  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1368  hypothetical protein  24 
 
 
145 aa  45.4  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>