22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0705 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0705  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3974  hypothetical protein  80.22 
 
 
182 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0661  hypothetical protein  81.32 
 
 
194 aa  294  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.109092 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0662  hypothetical protein  82.97 
 
 
182 aa  291  3e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.382195  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3360  hypothetical protein  82.97 
 
 
182 aa  291  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0674  hypothetical protein  73.63 
 
 
182 aa  287  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3679  hypothetical protein  73.63 
 
 
182 aa  286  8e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0695  hypothetical protein  73.08 
 
 
182 aa  286  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0705  hypothetical protein  73.08 
 
 
182 aa  285  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0675  hypothetical protein  48.8 
 
 
184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001153  hypothetical protein  36.26 
 
 
170 aa  124  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000282051  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06628  hypothetical protein  38.27 
 
 
151 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2913  hypothetical protein  31.29 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611181  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0370  hypothetical protein  34.48 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0444875  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0754  hypothetical protein  29.57 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1072  hypothetical protein  32.43 
 
 
203 aa  72  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.837571  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0390  hypothetical protein  30.25 
 
 
163 aa  58.2  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189667  unclonable  0.000000000389421 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1903  hypothetical protein  32.77 
 
 
181 aa  58.2  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153318  normal  0.201285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1368  hypothetical protein  25.24 
 
 
145 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004411  hypothetical protein  31.71 
 
 
113 aa  48.5  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00987  hypothetical protein  33.72 
 
 
113 aa  48.5  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0219  putative lipoprotein  28.87 
 
 
113 aa  47.8  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>