43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2112 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2112  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 
208 aa  400  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0090239  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1893  signal transduction histidine kinase, LytS  65.38 
 
 
208 aa  285  5e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3259  hypothetical protein  44.07 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.681558  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4407  signal transduction histidine kinase, LytS  42.05 
 
 
197 aa  127  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.501312  normal  0.0467499 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3066  hypothetical protein  43.5 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0574538 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3354  hypothetical protein  43.5 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4226  hypothetical protein  42.94 
 
 
192 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3452  signal transduction histidine kinase, LytS  43.15 
 
 
198 aa  122  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0334373 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3414  signal transduction histidine kinase, LytS  41.81 
 
 
192 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0817227 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3312  signal transduction histidine kinase LytS  41.81 
 
 
192 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3234  signal transduction histidine kinase, LytS  41.81 
 
 
192 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3309  signal transduction histidine kinase, LytS  41.81 
 
 
192 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3245  signal transduction histidine kinase, LytS  42.29 
 
 
192 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.769519  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2057  hypothetical protein  37.36 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000411468  normal  0.0571649 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1258  signal transduction histidine kinase, LytS  37.85 
 
 
191 aa  114  7.999999999999999e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000105467  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0648  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  35.23 
 
 
205 aa  113  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1045  hypothetical protein  40.11 
 
 
203 aa  106  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1651  signal transduction histidine kinase, LytS  41.62 
 
 
273 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.368777  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1105  hypothetical protein  41.21 
 
 
186 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.442881  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0398  signal transduction histidine kinase, LytS  32.37 
 
 
200 aa  96.7  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.530434  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0117  signal transduction histidine kinase, LytS  32.81 
 
 
199 aa  97.1  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0170867  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1291  hypothetical protein  32.77 
 
 
200 aa  95.1  7e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0838665  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1644  signal transduction histidine kinase, LytS  39.66 
 
 
280 aa  94.7  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000267326 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1453  hypothetical protein  31.02 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1112  signal transduction histidine kinase, LytS  38.36 
 
 
199 aa  92.4  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.605926  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1776  hypothetical protein  31.07 
 
 
200 aa  92  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.300821  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1658  hypothetical protein  34.78 
 
 
200 aa  91.3  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1706  hypothetical protein  38.02 
 
 
188 aa  89.4  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.10125  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0205  hypothetical protein  32.95 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.393317  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0894  hypothetical protein  37.61 
 
 
188 aa  86.3  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1104  hypothetical protein  29.09 
 
 
186 aa  84.7  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0842  hypothetical protein  30.36 
 
 
186 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.868834  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1571  hypothetical protein  30.77 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.180004  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0778  hypothetical protein  35.22 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1213  signal transduction histidine kinase, LytS  31.55 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1970  hypothetical protein  33.11 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.528306  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0280  signal transduction histidine kinase, LytS  30.25 
 
 
198 aa  78.6  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2259  hypothetical protein  33.11 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1510  hypothetical protein  29.61 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00594871  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0527  hypothetical protein  32.03 
 
 
185 aa  77.8  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1115  hypothetical protein  28.31 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0760  hypothetical protein  35.76 
 
 
182 aa  62.8  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1777  hypothetical protein  32.11 
 
 
159 aa  62  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>