42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0648 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0648  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  100 
 
 
205 aa  401  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1105  hypothetical protein  44.51 
 
 
186 aa  135  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.442881  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2057  hypothetical protein  38.55 
 
 
184 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000411468  normal  0.0571649 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0778  hypothetical protein  36.97 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2112  signal transduction histidine kinase, LytS  35.23 
 
 
208 aa  105  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0090239  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1776  hypothetical protein  33.52 
 
 
200 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.300821  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0398  signal transduction histidine kinase, LytS  35.26 
 
 
200 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.530434  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1453  hypothetical protein  33.52 
 
 
200 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1291  hypothetical protein  31.82 
 
 
200 aa  98.6  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0838665  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0117  signal transduction histidine kinase, LytS  28.65 
 
 
199 aa  98.2  7e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0170867  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1893  signal transduction histidine kinase, LytS  31.61 
 
 
208 aa  95.5  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0280  signal transduction histidine kinase, LytS  32.94 
 
 
198 aa  94  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1658  hypothetical protein  31.33 
 
 
200 aa  93.2  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1112  signal transduction histidine kinase, LytS  31.95 
 
 
199 aa  93.2  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.605926  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3414  signal transduction histidine kinase, LytS  31.79 
 
 
192 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0817227 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3234  signal transduction histidine kinase, LytS  31.79 
 
 
192 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3309  signal transduction histidine kinase, LytS  31.79 
 
 
192 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3312  signal transduction histidine kinase LytS  31.79 
 
 
192 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0205  hypothetical protein  29.94 
 
 
188 aa  88.6  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.393317  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4226  hypothetical protein  30.06 
 
 
192 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3354  hypothetical protein  30.06 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3066  hypothetical protein  30.06 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0574538 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1706  hypothetical protein  29.38 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.10125  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3259  hypothetical protein  30.64 
 
 
192 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.681558  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3245  signal transduction histidine kinase, LytS  30.64 
 
 
192 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.769519  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4407  signal transduction histidine kinase, LytS  31.18 
 
 
197 aa  85.1  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.501312  normal  0.0467499 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1213  signal transduction histidine kinase, LytS  29.66 
 
 
200 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0894  hypothetical protein  28.81 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1510  hypothetical protein  30 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00594871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1970  hypothetical protein  27.72 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.528306  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1258  signal transduction histidine kinase, LytS  27.81 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000105467  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1104  hypothetical protein  29.55 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2259  hypothetical protein  27.17 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1571  hypothetical protein  30.68 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.180004  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3452  signal transduction histidine kinase, LytS  30.39 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0334373 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0842  hypothetical protein  28.66 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.868834  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1115  hypothetical protein  31.21 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1777  hypothetical protein  33.63 
 
 
159 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0527  hypothetical protein  29.8 
 
 
185 aa  62.4  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1045  hypothetical protein  27.61 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1651  signal transduction histidine kinase, LytS  28.49 
 
 
273 aa  45.1  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.368777  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0388  hypothetical protein  39.02 
 
 
55 aa  41.2  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000000700551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>