43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3414 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3414  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 192 aa  364  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0817227 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3234  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 192 aa  364  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3309  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 192 aa  364  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3312  signal transduction histidine kinase LytS  100 
 
 		 192 aa  364  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3245  signal transduction histidine kinase, LytS  98.96 
 
 		 192 aa  362  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.769519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3066  hypothetical protein  93.23 
 
 		 192 aa  319  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0574538 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3354  hypothetical protein  92.71 
 
 		 192 aa  317  7e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4226  hypothetical protein  92.19 
 
 		 192 aa  315  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3259  hypothetical protein  91.67 
 
 		 192 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.681558  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1893  signal transduction histidine kinase, LytS  46.86 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2112  signal transduction histidine kinase, LytS  42.29 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0090239  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4407  signal transduction histidine kinase, LytS  42.39 
 
 		 197 aa  124  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.501312  normal  0.0467499 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2057  hypothetical protein  42.08 
 
 		 184 aa  122  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000411468  normal  0.0571649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3452  signal transduction histidine kinase, LytS  42.93 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334373 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1105  hypothetical protein  43.98 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.442881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0398  signal transduction histidine kinase, LytS  36.48 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.530434  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1112  signal transduction histidine kinase, LytS  36.36 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.605926  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1291  hypothetical protein  35.8 
 
 		 200 aa  104  9e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0838665  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0648  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  31.79 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1658  hypothetical protein  38.27 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1453  hypothetical protein  35.19 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1970  hypothetical protein  35.63 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.528306  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1776  hypothetical protein  33.14 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.300821  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2259  hypothetical protein  35.63 
 
 		 185 aa  98.6  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0117  signal transduction histidine kinase, LytS  29.73 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0170867  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0778  hypothetical protein  30.41 
 
 		 185 aa  95.1  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1258  signal transduction histidine kinase, LytS  33.71 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000105467  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1213  signal transduction histidine kinase, LytS  34.44 
 
 		 200 aa  90.5  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0280  signal transduction histidine kinase, LytS  31.28 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0760  hypothetical protein  33.95 
 
 		 182 aa  85.1  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0527  hypothetical protein  29.48 
 
 		 185 aa  84.7  7e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1045  hypothetical protein  32.02 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1510  hypothetical protein  38.41 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00594871  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1644  signal transduction histidine kinase, LytS  34.08 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000267326 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1115  hypothetical protein  32.93 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1651  signal transduction histidine kinase, LytS  33.15 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.368777  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1104  hypothetical protein  28.16 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0894  hypothetical protein  29.88 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1706  hypothetical protein  29.88 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.10125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1571  hypothetical protein  29.22 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.180004  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0205  hypothetical protein  28.98 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.393317  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1777  hypothetical protein  32.43 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0842  hypothetical protein  26.19 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.868834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>