41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0760 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0760  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  347  6e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0527  hypothetical protein  52.67 
 
 
185 aa  149  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1970  hypothetical protein  37.5 
 
 
185 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.528306  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2259  hypothetical protein  37.5 
 
 
185 aa  120  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3066  hypothetical protein  35.33 
 
 
192 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0574538 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3354  hypothetical protein  35.76 
 
 
192 aa  89.4  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4226  hypothetical protein  36.71 
 
 
192 aa  88.6  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3259  hypothetical protein  35.37 
 
 
192 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.681558  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3309  signal transduction histidine kinase, LytS  33.53 
 
 
192 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3312  signal transduction histidine kinase LytS  33.53 
 
 
192 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3234  signal transduction histidine kinase, LytS  33.53 
 
 
192 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3414  signal transduction histidine kinase, LytS  33.53 
 
 
192 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0817227 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3245  signal transduction histidine kinase, LytS  33.95 
 
 
192 aa  85.1  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.769519  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0398  signal transduction histidine kinase, LytS  34.5 
 
 
200 aa  85.1  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.530434  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1291  hypothetical protein  34.94 
 
 
200 aa  84.3  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0838665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1453  hypothetical protein  34.34 
 
 
200 aa  82  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1776  hypothetical protein  34.34 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.300821  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0280  signal transduction histidine kinase, LytS  31.03 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1112  signal transduction histidine kinase, LytS  27.61 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.605926  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0117  signal transduction histidine kinase, LytS  28.24 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0170867  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1258  signal transduction histidine kinase, LytS  31.61 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000105467  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2057  hypothetical protein  31.55 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000411468  normal  0.0571649 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1045  hypothetical protein  30.51 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1893  signal transduction histidine kinase, LytS  31.21 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0778  hypothetical protein  28.76 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2112  signal transduction histidine kinase, LytS  32.61 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0090239  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1115  hypothetical protein  29.19 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1213  signal transduction histidine kinase, LytS  26.32 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4407  signal transduction histidine kinase, LytS  30.39 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.501312  normal  0.0467499 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0842  hypothetical protein  27.4 
 
 
186 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.868834  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1104  hypothetical protein  27.4 
 
 
186 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1571  hypothetical protein  27.21 
 
 
186 aa  61.6  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.180004  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1105  hypothetical protein  33.12 
 
 
186 aa  61.6  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.442881  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1658  hypothetical protein  26.09 
 
 
200 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1510  hypothetical protein  39.18 
 
 
188 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00594871  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1706  hypothetical protein  31.45 
 
 
188 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.10125  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3452  signal transduction histidine kinase, LytS  29.83 
 
 
198 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0334373 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0205  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  52.4  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.393317  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0894  hypothetical protein  32.46 
 
 
188 aa  50.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1777  hypothetical protein  25.69 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0648  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  26.25 
 
 
205 aa  47.8  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>