40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1706 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1706  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  366  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.10125  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0205  hypothetical protein  90.43 
 
 
188 aa  340  1e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.393317  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0894  hypothetical protein  89.89 
 
 
188 aa  338  2e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1510  hypothetical protein  60.11 
 
 
188 aa  234  4e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00594871  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1105  hypothetical protein  37.43 
 
 
186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.442881  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2057  hypothetical protein  31.05 
 
 
184 aa  89  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000411468  normal  0.0571649 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1893  signal transduction histidine kinase, LytS  36.07 
 
 
208 aa  89  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0117  signal transduction histidine kinase, LytS  32.93 
 
 
199 aa  88.2  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0170867  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0648  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  29.38 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1970  hypothetical protein  30.69 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.528306  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2112  signal transduction histidine kinase, LytS  38.02 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0090239  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2259  hypothetical protein  30.16 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1104  hypothetical protein  32.32 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1112  signal transduction histidine kinase, LytS  30.68 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.605926  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3452  signal transduction histidine kinase, LytS  39.25 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0334373 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0842  hypothetical protein  31.93 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.868834  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1213  signal transduction histidine kinase, LytS  34.23 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0778  hypothetical protein  27.75 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1776  hypothetical protein  29.45 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.300821  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4407  signal transduction histidine kinase, LytS  30.27 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.501312  normal  0.0467499 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0398  signal transduction histidine kinase, LytS  29.89 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.530434  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0280  signal transduction histidine kinase, LytS  30.57 
 
 
198 aa  71.2  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1658  hypothetical protein  30.29 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1453  hypothetical protein  28.22 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1571  hypothetical protein  32 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.180004  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1291  hypothetical protein  27.61 
 
 
200 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0838665  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1115  hypothetical protein  37.61 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1258  signal transduction histidine kinase, LytS  25.15 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000105467  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3066  hypothetical protein  36.36 
 
 
192 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0574538 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3354  hypothetical protein  36.36 
 
 
192 aa  61.2  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4226  hypothetical protein  36.36 
 
 
192 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1777  hypothetical protein  37.23 
 
 
159 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3259  hypothetical protein  37.27 
 
 
192 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.681558  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3312  signal transduction histidine kinase LytS  29.88 
 
 
192 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3309  signal transduction histidine kinase, LytS  29.88 
 
 
192 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3234  signal transduction histidine kinase, LytS  29.88 
 
 
192 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3414  signal transduction histidine kinase, LytS  29.88 
 
 
192 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0817227 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3245  signal transduction histidine kinase, LytS  29.27 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.769519  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0527  hypothetical protein  28.57 
 
 
185 aa  53.1  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1045  hypothetical protein  30.3 
 
 
203 aa  52.8  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>