43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4407 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4407  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 197 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.501312  normal  0.0467499 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3452  signal transduction histidine kinase, LytS  90.67 
 
 		 198 aa  311  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334373 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1893  signal transduction histidine kinase, LytS  42.7 
 
 		 208 aa  144  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1651  signal transduction histidine kinase, LytS  46.96 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.368777  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1644  signal transduction histidine kinase, LytS  44.51 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000267326 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2112  signal transduction histidine kinase, LytS  42.05 
 
 		 208 aa  132  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0090239  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2057  hypothetical protein  41.42 
 
 		 184 aa  116  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000411468  normal  0.0571649 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1970  hypothetical protein  36.87 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.528306  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4226  hypothetical protein  43.48 
 
 		 192 aa  115  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2259  hypothetical protein  36.31 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3354  hypothetical protein  42.93 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3234  signal transduction histidine kinase, LytS  42.39 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3312  signal transduction histidine kinase LytS  42.39 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3309  signal transduction histidine kinase, LytS  42.39 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3414  signal transduction histidine kinase, LytS  42.39 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0817227 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3259  hypothetical protein  42.93 
 
 		 192 aa  112  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.681558  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3066  hypothetical protein  42.39 
 
 		 192 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0574538 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3245  signal transduction histidine kinase, LytS  41.85 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.769519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1105  hypothetical protein  38.64 
 
 		 186 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.442881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1258  signal transduction histidine kinase, LytS  35.29 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000105467  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1453  hypothetical protein  35.56 
 
 		 200 aa  95.5  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0648  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  31.18 
 
 		 205 aa  94.7  8e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1291  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0838665  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0398  signal transduction histidine kinase, LytS  35.96 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.530434  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1776  hypothetical protein  35.91 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.300821  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1112  signal transduction histidine kinase, LytS  34.36 
 
 		 199 aa  85.1  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.605926  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1213  signal transduction histidine kinase, LytS  33.54 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0205  hypothetical protein  30.34 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.393317  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0894  hypothetical protein  29.78 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1706  hypothetical protein  30.85 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.10125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0117  signal transduction histidine kinase, LytS  28.57 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0170867  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1115  hypothetical protein  32.93 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1104  hypothetical protein  28.18 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1045  hypothetical protein  31.49 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0842  hypothetical protein  27.07 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.868834  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1658  hypothetical protein  31.18 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1510  hypothetical protein  38.39 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00594871  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0778  hypothetical protein  32.39 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1571  hypothetical protein  25.41 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.180004  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0527  hypothetical protein  28.95 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1777  hypothetical protein  30.91 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0280  signal transduction histidine kinase, LytS  24.35 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0760  hypothetical protein  31.52 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>