42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0280 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0280  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 
198 aa  372  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1658  hypothetical protein  41.21 
 
 
200 aa  150  8.999999999999999e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1112  signal transduction histidine kinase, LytS  43.45 
 
 
199 aa  144  6e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.605926  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1291  hypothetical protein  43.01 
 
 
200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0838665  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1776  hypothetical protein  41.3 
 
 
200 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.300821  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0398  signal transduction histidine kinase, LytS  41.3 
 
 
200 aa  138  6e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.530434  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1453  hypothetical protein  41.85 
 
 
200 aa  137  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1213  signal transduction histidine kinase, LytS  40.88 
 
 
200 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0117  signal transduction histidine kinase, LytS  39.66 
 
 
199 aa  127  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0170867  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1571  hypothetical protein  37.08 
 
 
186 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.180004  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0842  hypothetical protein  35.59 
 
 
186 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.868834  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1104  hypothetical protein  35.23 
 
 
186 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1115  hypothetical protein  39.64 
 
 
184 aa  99.4  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0648  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  32.94 
 
 
205 aa  94  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1777  hypothetical protein  33.78 
 
 
159 aa  90.1  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1105  hypothetical protein  34.71 
 
 
186 aa  85.1  7e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.442881  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3259  hypothetical protein  33.12 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.681558  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1893  signal transduction histidine kinase, LytS  31.02 
 
 
208 aa  81.3  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3354  hypothetical protein  32.5 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3066  hypothetical protein  32.5 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0574538 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4226  hypothetical protein  32.5 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3312  signal transduction histidine kinase LytS  31.28 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3309  signal transduction histidine kinase, LytS  31.28 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3234  signal transduction histidine kinase, LytS  31.28 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3414  signal transduction histidine kinase, LytS  31.28 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0817227 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0778  hypothetical protein  29.52 
 
 
185 aa  77  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3245  signal transduction histidine kinase, LytS  30.73 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.769519  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0205  hypothetical protein  31.87 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.393317  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1706  hypothetical protein  30.57 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.10125  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2112  signal transduction histidine kinase, LytS  30.25 
 
 
208 aa  71.2  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0090239  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0894  hypothetical protein  37.61 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1510  hypothetical protein  31.03 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00594871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1970  hypothetical protein  26.67 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.528306  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2259  hypothetical protein  26.67 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0760  hypothetical protein  32.1 
 
 
182 aa  64.7  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2057  hypothetical protein  28.66 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000411468  normal  0.0571649 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0527  hypothetical protein  23.12 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4407  signal transduction histidine kinase, LytS  24.35 
 
 
197 aa  58.2  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.501312  normal  0.0467499 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1045  hypothetical protein  25.56 
 
 
203 aa  55.8  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1258  signal transduction histidine kinase, LytS  29.63 
 
 
191 aa  50.1  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000105467  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3452  signal transduction histidine kinase, LytS  35.14 
 
 
198 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0334373 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1651  signal transduction histidine kinase, LytS  30.77 
 
 
273 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.368777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>