42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1970 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1970  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  358  2e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.528306  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2259  hypothetical protein  99.46 
 
 		 185 aa  356  9e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4407  signal transduction histidine kinase, LytS  36.87 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.501312  normal  0.0467499 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0527  hypothetical protein  35.85 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0760  hypothetical protein  38.04 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3066  hypothetical protein  34.86 
 
 		 192 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0574538 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3354  hypothetical protein  34.88 
 
 		 192 aa  92.4  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3309  signal transduction histidine kinase, LytS  35.63 
 
 		 192 aa  91.3  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3312  signal transduction histidine kinase LytS  35.63 
 
 		 192 aa  91.3  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3234  signal transduction histidine kinase, LytS  35.63 
 
 		 192 aa  91.3  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3414  signal transduction histidine kinase, LytS  35.63 
 
 		 192 aa  91.3  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0817227 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4226  hypothetical protein  34.88 
 
 		 192 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3452  signal transduction histidine kinase, LytS  34.57 
 
 		 198 aa  90.5  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334373 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2057  hypothetical protein  30.39 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000411468  normal  0.0571649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3245  signal transduction histidine kinase, LytS  35.06 
 
 		 192 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.769519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3259  hypothetical protein  34.3 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.681558  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1776  hypothetical protein  30.36 
 
 		 200 aa  80.9  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.300821  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1453  hypothetical protein  30.36 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1706  hypothetical protein  30.69 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.10125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0648  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  27.72 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1291  hypothetical protein  30.43 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0838665  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0894  hypothetical protein  30.16 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0117  signal transduction histidine kinase, LytS  30.13 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0170867  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0398  signal transduction histidine kinase, LytS  31.71 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.530434  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1105  hypothetical protein  32.2 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.442881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0842  hypothetical protein  33.11 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.868834  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1104  hypothetical protein  30.06 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1571  hypothetical protein  33.11 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.180004  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2112  signal transduction histidine kinase, LytS  33.11 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0090239  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1112  signal transduction histidine kinase, LytS  26.19 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.605926  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0205  hypothetical protein  27.81 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.393317  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1893  signal transduction histidine kinase, LytS  29.82 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1115  hypothetical protein  30.11 
 
 		 184 aa  72  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1658  hypothetical protein  28.48 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1045  hypothetical protein  34.36 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1213  signal transduction histidine kinase, LytS  28.67 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1258  signal transduction histidine kinase, LytS  26.78 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000105467  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1510  hypothetical protein  28.65 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00594871  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0280  signal transduction histidine kinase, LytS  26.67 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0778  hypothetical protein  29.49 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1777  hypothetical protein  26.61 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1651  signal transduction histidine kinase, LytS  29.38 
 
 		 273 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.368777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>