41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3013 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3013    100 
 
 		 5762 bp  11420    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3016  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 		 825 bp  1635    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3017  transposase  100 
 
 		 1698 bp  3366    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0221  transposase  100 
 
 		 1698 bp  3366    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113746  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3226  transposase  100 
 
 		 1698 bp  3366    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0222  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 		 825 bp  1635    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.923755  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3227  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 		 825 bp  1635    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4310    87.39 
 
 		 1711 bp  1392    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0997225  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1870  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 		 825 bp  1635    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1871  transposase  100 
 
 		 1698 bp  3366    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4311    91.96 
 
 		 477 bp  618  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191734  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3228  hypothetical protein  100 
 
 		 234 bp  464  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0223  hypothetical protein  100 
 
 		 234 bp  464  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1869  hypothetical protein  100 
 
 		 234 bp  464  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3015  hypothetical protein  100 
 
 		 234 bp  464  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1779  IstB ATP binding domain-containing protein  83.58 
 
 		 816 bp  274  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.330119  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5334    83.84 
 
 		 780 bp  256  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3470  IstB domain protein ATP-binding protein  83.84 
 
 		 780 bp  256  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000505364  hitchhiker  0.00163359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3046  IstB domain protein ATP-binding protein  83.84 
 
 		 780 bp  256  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000101378  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2080  IstB domain protein ATP-binding protein  83.84 
 
 		 780 bp  256  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00584299  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3669  IstB domain protein ATP-binding protein  82.96 
 
 		 792 bp  196  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0388523  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0469  IstB ATP binding domain-containing protein  84.9 
 
 		 819 bp  192  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3657  IstB domain protein ATP-binding protein  80.87 
 
 		 792 bp  182  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.32372  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4518  IstB domain protein ATP-binding protein  80.87 
 
 		 792 bp  182  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2531  IstB domain protein ATP-binding protein  80.87 
 
 		 792 bp  182  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000490561  hitchhiker  0.00141169 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0424  IstB domain protein ATP-binding protein  80.87 
 
 		 792 bp  182  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0459  IstB ATP binding domain-containing protein  79.71 
 
 		 819 bp  182  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.498177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5833    85.25 
 
 		 450 bp  149  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2719    83.5 
 
 		 336 bp  127  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.705936 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  81.43 
 
 		 1677 bp  121  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0458  transposase  81.15 
 
 		 1755 bp  119  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3225  ABC transporter related protein  100 
 
 		 1134 bp  81.8  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2624  hypothetical protein  80.72 
 
 		 378 bp  75.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4309    93.48 
 
 		 147 bp  67.9  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0341723  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4517  IstA2  90 
 
 		 1668 bp  60  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3656  IstA2  90 
 
 		 1671 bp  60  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.165396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2530  IstA2  90 
 
 		 1620 bp  60  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000787231  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0425    90 
 
 		 3175 bp  60  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3265  IstB ATP binding domain-containing protein  92.5 
 
 		 798 bp  56  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0499602  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3668  IstA2  85.71 
 
 		 1695 bp  54  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0182144  normal  0.155285 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5655  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 		 744 bp  50.1  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>