22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5833 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5833    100 
 
 
450 bp  892    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1779  IstB ATP binding domain-containing protein  85.86 
 
 
816 bp  165  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.330119  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3227  IstB domain protein ATP-binding protein  85.25 
 
 
825 bp  149  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3016  IstB domain protein ATP-binding protein  85.25 
 
 
825 bp  149  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3013    85.25 
 
 
5762 bp  149  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1870  IstB domain protein ATP-binding protein  85.25 
 
 
825 bp  149  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0222  IstB domain protein ATP-binding protein  85.25 
 
 
825 bp  149  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.923755  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3669  IstB domain protein ATP-binding protein  85.96 
 
 
792 bp  149  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0388523  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2080  IstB domain protein ATP-binding protein  86.62 
 
 
780 bp  145  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00584299  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3046  IstB domain protein ATP-binding protein  86.62 
 
 
780 bp  145  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000101378  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3470  IstB domain protein ATP-binding protein  86.62 
 
 
780 bp  145  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000505364  hitchhiker  0.00163359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5334    86.62 
 
 
780 bp  145  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2719    86.18 
 
 
336 bp  135  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.705936 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3657  IstB domain protein ATP-binding protein  83.77 
 
 
792 bp  133  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.32372  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4311    83.77 
 
 
477 bp  133  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191734  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4518  IstB domain protein ATP-binding protein  83.77 
 
 
792 bp  133  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2531  IstB domain protein ATP-binding protein  83.77 
 
 
792 bp  133  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000490561  hitchhiker  0.00141169 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0424  IstB domain protein ATP-binding protein  83.77 
 
 
792 bp  133  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0469  IstB ATP binding domain-containing protein  83.54 
 
 
819 bp  111  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2624  hypothetical protein  83.23 
 
 
378 bp  109  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0459  IstB ATP binding domain-containing protein  81.15 
 
 
819 bp  93.7  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.498177  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3265  IstB ATP binding domain-containing protein  84.93 
 
 
798 bp  58  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0499602  normal  0.844139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>