24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2719 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2719    100 
 
 		 336 bp  666    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.705936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2624  hypothetical protein  87.44 
 
 		 378 bp  180  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4311    84.08 
 
 		 477 bp  137  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5833    86.18 
 
 		 450 bp  135  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3227  IstB domain protein ATP-binding protein  83.5 
 
 		 825 bp  127  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3016  IstB domain protein ATP-binding protein  83.5 
 
 		 825 bp  127  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3013    83.5 
 
 		 5762 bp  127  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1870  IstB domain protein ATP-binding protein  83.5 
 
 		 825 bp  127  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0222  IstB domain protein ATP-binding protein  83.5 
 
 		 825 bp  127  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.923755  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1779  IstB ATP binding domain-containing protein  89.72 
 
 		 816 bp  125  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.330119  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0424  IstB domain protein ATP-binding protein  89.11 
 
 		 792 bp  113  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2531  IstB domain protein ATP-binding protein  89.11 
 
 		 792 bp  113  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000490561  hitchhiker  0.00141169 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3657  IstB domain protein ATP-binding protein  89.11 
 
 		 792 bp  113  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.32372  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4518  IstB domain protein ATP-binding protein  89.11 
 
 		 792 bp  113  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0469  IstB ATP binding domain-containing protein  85.98 
 
 		 819 bp  93.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3470  IstB domain protein ATP-binding protein  93.33 
 
 		 780 bp  87.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000505364  hitchhiker  0.00163359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5334    93.33 
 
 		 780 bp  87.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3046  IstB domain protein ATP-binding protein  93.33 
 
 		 780 bp  87.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000101378  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2080  IstB domain protein ATP-binding protein  93.33 
 
 		 780 bp  87.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00584299  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3669  IstB domain protein ATP-binding protein  84.62 
 
 		 792 bp  79.8  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0388523  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0459  IstB ATP binding domain-containing protein  82.69 
 
 		 819 bp  63.9  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.498177  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3109    87.5 
 
 		 340 bp  56  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3529  methyltransferase type 12  100 
 
 		 624 bp  50.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354296  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3265  IstB ATP binding domain-containing protein  81.61 
 
 		 798 bp  46.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0499602  normal  0.844139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>