26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5334 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5334    100 
 
 		 780 bp  1546    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3470  IstB domain protein ATP-binding protein  99.87 
 
 		 780 bp  1538    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000505364  hitchhiker  0.00163359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3046  IstB domain protein ATP-binding protein  99.87 
 
 		 780 bp  1538    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000101378  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2080  IstB domain protein ATP-binding protein  99.87 
 
 		 780 bp  1538    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00584299  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4311    83.61 
 
 		 477 bp  291  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191734  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1779  IstB ATP binding domain-containing protein  84.7 
 
 		 816 bp  281  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.330119  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3669  IstB domain protein ATP-binding protein  83.9 
 
 		 792 bp  272  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0388523  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3227  IstB domain protein ATP-binding protein  83.84 
 
 		 825 bp  256  8.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3016  IstB domain protein ATP-binding protein  83.84 
 
 		 825 bp  256  8.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3013    83.84 
 
 		 5762 bp  256  8.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1870  IstB domain protein ATP-binding protein  83.84 
 
 		 825 bp  256  8.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0222  IstB domain protein ATP-binding protein  83.84 
 
 		 825 bp  256  8.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.923755  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0469  IstB ATP binding domain-containing protein  83.29 
 
 		 819 bp  236  8.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3657  IstB domain protein ATP-binding protein  81.77 
 
 		 792 bp  218  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.32372  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4518  IstB domain protein ATP-binding protein  81.77 
 
 		 792 bp  218  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2531  IstB domain protein ATP-binding protein  81.77 
 
 		 792 bp  218  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000490561  hitchhiker  0.00141169 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0424  IstB domain protein ATP-binding protein  81.77 
 
 		 792 bp  218  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0459  IstB ATP binding domain-containing protein  82.15 
 
 		 819 bp  200  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.498177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5833    86.62 
 
 		 450 bp  145  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2624  hypothetical protein  82.1 
 
 		 378 bp  91.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2719    93.33 
 
 		 336 bp  87.7  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.705936 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3265  IstB ATP binding domain-containing protein  81.31 
 
 		 798 bp  54  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0499602  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3109    100 
 
 		 340 bp  52  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3057  IstB-like ATP-binding protein  93.75 
 
 		 864 bp  48.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.965627  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2967  hypothetical protein  96.43 
 
 		 216 bp  48.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3044  IstB-like ATP-binding protein  93.75 
 
 		 864 bp  48.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>