7 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3109 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3109    100 
 
 		 340 bp  674    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2719    87.5 
 
 		 336 bp  56  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.705936 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2080  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 		 780 bp  52  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00584299  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3046  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 		 780 bp  52  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000101378  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3470  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 		 780 bp  52  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000505364  hitchhiker  0.00163359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5334    100 
 
 		 780 bp  52  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4311    100 
 
 		 477 bp  48.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>