19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0575 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0575  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  524  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0585  hypothetical protein  53.46 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332625  decreased coverage  0.00157125 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2197  hypothetical protein  51.75 
 
 		 258 aa  252  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  hitchhiker  0.00799325 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3584  hypothetical protein  52.29 
 
 		 268 aa  241  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462039  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3283  hypothetical protein  51.53 
 
 		 268 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6645  hypothetical protein  51.66 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3149  phytanoyl-CoA dioxygenase  53.5 
 
 		 263 aa  231  7.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.534046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2566  hypothetical protein  51.32 
 
 		 263 aa  230  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3377  hypothetical protein  47.88 
 
 		 259 aa  228  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1191  hypothetical protein  41.45 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2727  hypothetical protein  44.83 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2697  hypothetical protein  44.4 
 
 		 242 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446497  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2741  hypothetical protein  44.4 
 
 		 242 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.369564  normal  0.54067 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3563  hypothetical protein  32.48 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.012518  normal  0.12752 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08599  conserved hypothetical protein  27.43 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3554  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.38 
 
 		 360 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0164  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.63 
 
 		 670 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0180  hypothetical protein  25.63 
 
 		 669 aa  50.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3935  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.18 
 
 		 306 aa  42  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>