14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3563 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3563  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  578  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.012518  normal  0.12752 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08599  conserved hypothetical protein  43.46 
 
 		 331 aa  240  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3283  hypothetical protein  29.71 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3584  hypothetical protein  29.35 
 
 		 268 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462039  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2566  hypothetical protein  31.48 
 
 		 263 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0585  hypothetical protein  30.77 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332625  decreased coverage  0.00157125 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2197  hypothetical protein  29.77 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  hitchhiker  0.00799325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6645  hypothetical protein  30.25 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0575  hypothetical protein  32.48 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3149  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.16 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.534046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3377  hypothetical protein  27.34 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1191  hypothetical protein  27.23 
 
 		 232 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4193  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.61 
 
 		 681 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0166  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.36 
 
 		 685 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.237009 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>