15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3377 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3377  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  535  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0585  hypothetical protein  66.15 
 
 
255 aa  356  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332625  decreased coverage  0.00157125 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2197  hypothetical protein  64.34 
 
 
258 aa  338  7e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  hitchhiker  0.00799325 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3584  hypothetical protein  58.3 
 
 
268 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462039  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3283  hypothetical protein  57.53 
 
 
268 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3149  phytanoyl-CoA dioxygenase  51.76 
 
 
263 aa  249  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.534046  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6645  hypothetical protein  51.32 
 
 
273 aa  246  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2566  hypothetical protein  48.85 
 
 
263 aa  241  9e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0575  hypothetical protein  47.88 
 
 
262 aa  215  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1191  hypothetical protein  39.06 
 
 
232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2697  hypothetical protein  38.59 
 
 
242 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446497  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2741  hypothetical protein  38.59 
 
 
242 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.369564  normal  0.54067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2727  hypothetical protein  38.79 
 
 
242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3563  hypothetical protein  27.34 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.012518  normal  0.12752 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08599  conserved hypothetical protein  24.74 
 
 
331 aa  58.9  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>