15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3149 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3149  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 263 aa  530  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.534046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3283  hypothetical protein  54.44 
 
 		 268 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2197  hypothetical protein  53.12 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  hitchhiker  0.00799325 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0585  hypothetical protein  55.38 
 
 		 255 aa  260  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332625  decreased coverage  0.00157125 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3584  hypothetical protein  52.77 
 
 		 268 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462039  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2566  hypothetical protein  54.41 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3377  hypothetical protein  51.76 
 
 		 259 aa  249  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6645  hypothetical protein  49.06 
 
 		 273 aa  225  7e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0575  hypothetical protein  53.5 
 
 		 262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1191  hypothetical protein  39.74 
 
 		 232 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2727  hypothetical protein  41.3 
 
 		 242 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2697  hypothetical protein  42.57 
 
 		 242 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446497  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2741  hypothetical protein  42.57 
 
 		 242 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.369564  normal  0.54067 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3563  hypothetical protein  28.16 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.012518  normal  0.12752 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08599  conserved hypothetical protein  27.92 
 
 		 331 aa  58.9  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>