19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2566 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2566  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  526  1e-148  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6645  hypothetical protein  67.42 
 
 		 273 aa  345  3e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3283  hypothetical protein  57.25 
 
 		 268 aa  291  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3584  hypothetical protein  56.18 
 
 		 268 aa  285  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462039  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0585  hypothetical protein  51.54 
 
 		 255 aa  251  8.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332625  decreased coverage  0.00157125 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2197  hypothetical protein  50.97 
 
 		 258 aa  249  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  hitchhiker  0.00799325 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3149  phytanoyl-CoA dioxygenase  54.41 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.534046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3377  hypothetical protein  48.85 
 
 		 259 aa  241  9e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0575  hypothetical protein  51.32 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1191  hypothetical protein  44.05 
 
 		 232 aa  165  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2741  hypothetical protein  44.87 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.369564  normal  0.54067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2697  hypothetical protein  44.87 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446497  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2727  hypothetical protein  43.83 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3563  hypothetical protein  31.48 
 
 		 289 aa  90.5  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.012518  normal  0.12752 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08599  conserved hypothetical protein  28.83 
 
 		 331 aa  89.7  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0164  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.65 
 
 		 670 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3554  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.98 
 
 		 360 aa  46.6  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3935  phytanoyl-CoA dioxygenase  19.91 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  24.89 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>