21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3554 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3554  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 360 aa  738    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0166  phytanoyl-CoA dioxygenase  72.44 
 
 		 685 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.237009 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0162  phytanoyl-CoA dioxygenase  71.84 
 
 		 681 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4193  phytanoyl-CoA dioxygenase  70.98 
 
 		 681 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0180  hypothetical protein  74.26 
 
 		 669 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0164  phytanoyl-CoA dioxygenase  73.16 
 
 		 670 aa  496  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4531  phytanoyl-CoA dioxygenase  39.63 
 
 		 333 aa  219  7.999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3935  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.96 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5281  hypothetical protein  30.56 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4379  hypothetical protein  31.74 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0857974  decreased coverage  0.00079087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1668  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.4 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119569  Conserved protein of unknown function  21.51 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.434648  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00380  hypothetical protein  23.32 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.713282  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07227  conserved hypothetical protein  24.39 
 
 		 431 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0207554  normal  0.22755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0585  hypothetical protein  22.94 
 
 		 255 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332625  decreased coverage  0.00157125 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07787  conserved hypothetical protein  21.99 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.289994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2566  hypothetical protein  22.98 
 
 		 263 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08471  conserved hypothetical protein  26.74 
 
 		 352 aa  46.6  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3283  hypothetical protein  24.3 
 
 		 268 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.58 
 
 		 253 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3404  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin, putative  30 
 
 		 252 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>