22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0164 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0180  hypothetical protein  81.46 
 
 		 669 aa  1098    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0166  phytanoyl-CoA dioxygenase  66.81 
 
 		 685 aa  915    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.237009 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0162  phytanoyl-CoA dioxygenase  66.03 
 
 		 681 aa  904    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0164  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 670 aa  1373    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4193  phytanoyl-CoA dioxygenase  66.76 
 
 		 681 aa  916    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3554  phytanoyl-CoA dioxygenase  73.16 
 
 		 360 aa  496  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4531  phytanoyl-CoA dioxygenase  38.39 
 
 		 333 aa  214  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3935  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.38 
 
 		 306 aa  204  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4258  hypothetical protein  31.58 
 
 		 344 aa  118  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4428  hypothetical protein  30.34 
 
 		 269 aa  104  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1668  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.44 
 
 		 315 aa  104  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5281  hypothetical protein  30.3 
 
 		 323 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2864  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family  34.62 
 
 		 322 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4379  hypothetical protein  29.57 
 
 		 320 aa  92.8  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0857974  decreased coverage  0.00079087 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1666  hypothetical protein  29.24 
 
 		 434 aa  83.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.371898  normal  0.651682 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119569  Conserved protein of unknown function  21.33 
 
 		 443 aa  57  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.434648  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00380  hypothetical protein  24.21 
 
 		 325 aa  57  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.713282  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07787  conserved hypothetical protein  23.48 
 
 		 342 aa  52.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.289994  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07227  conserved hypothetical protein  22.88 
 
 		 431 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0207554  normal  0.22755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0585  hypothetical protein  23.38 
 
 		 255 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332625  decreased coverage  0.00157125 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2566  hypothetical protein  22.65 
 
 		 263 aa  47.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3283  hypothetical protein  25.6 
 
 		 268 aa  45.8  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>