18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4379 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4379  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  669    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0857974  decreased coverage  0.00079087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5281  hypothetical protein  73.35 
 
 		 323 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1668  Phytanoyl-CoA dioxygenase  75.88 
 
 		 315 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4531  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.33 
 
 		 333 aa  119  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0166  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.78 
 
 		 685 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.237009 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0162  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.03 
 
 		 681 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4193  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.36 
 
 		 681 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3554  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.74 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3935  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.16 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0180  hypothetical protein  31.47 
 
 		 669 aa  99.8  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0164  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.57 
 
 		 670 aa  92.8  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07787  conserved hypothetical protein  25.8 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.289994  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07227  conserved hypothetical protein  26.07 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0207554  normal  0.22755 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08471  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02080  hypothetical protein  27.92 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.595196  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08475  conserved hypothetical protein  24.38 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.604735 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  21.89 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0585  hypothetical protein  26.67 
 
 		 255 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332625  decreased coverage  0.00157125 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>