19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0180 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0180  hypothetical protein  100 
 
 		 669 aa  1371    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0166  phytanoyl-CoA dioxygenase  68.57 
 
 		 685 aa  933    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.237009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0164  phytanoyl-CoA dioxygenase  81.46 
 
 		 670 aa  1113    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4193  phytanoyl-CoA dioxygenase  68.24 
 
 		 681 aa  931    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0162  phytanoyl-CoA dioxygenase  68.09 
 
 		 681 aa  931    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3554  phytanoyl-CoA dioxygenase  74.26 
 
 		 360 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4531  phytanoyl-CoA dioxygenase  36.62 
 
 		 333 aa  220  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3935  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.13 
 
 		 306 aa  203  7e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4258  hypothetical protein  31.85 
 
 		 344 aa  128  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4428  hypothetical protein  33.21 
 
 		 269 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1668  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.86 
 
 		 315 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5281  hypothetical protein  30.97 
 
 		 323 aa  105  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4379  hypothetical protein  31.47 
 
 		 320 aa  99.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0857974  decreased coverage  0.00079087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2864  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family  36.48 
 
 		 322 aa  97.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1666  hypothetical protein  30.29 
 
 		 434 aa  87.4  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.371898  normal  0.651682 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119569  Conserved protein of unknown function  21.71 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.434648  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00380  hypothetical protein  22.95 
 
 		 325 aa  54.7  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.713282  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07227  conserved hypothetical protein  23.73 
 
 		 431 aa  50.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0207554  normal  0.22755 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07787  conserved hypothetical protein  24.9 
 
 		 342 aa  48.5  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.289994  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>