17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3283 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3283  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3584  hypothetical protein  87.59 
 
 
268 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462039  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2566  hypothetical protein  57.25 
 
 
263 aa  291  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0585  hypothetical protein  58.62 
 
 
255 aa  288  9e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332625  decreased coverage  0.00157125 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3377  hypothetical protein  57.53 
 
 
259 aa  280  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2197  hypothetical protein  55 
 
 
258 aa  279  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  hitchhiker  0.00799325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6645  hypothetical protein  54.55 
 
 
273 aa  266  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3149  phytanoyl-CoA dioxygenase  54.44 
 
 
263 aa  264  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.534046  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0575  hypothetical protein  51.53 
 
 
262 aa  224  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1191  hypothetical protein  43.56 
 
 
232 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2741  hypothetical protein  45.61 
 
 
242 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.369564  normal  0.54067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2697  hypothetical protein  45.61 
 
 
242 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446497  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2727  hypothetical protein  44.3 
 
 
242 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3563  hypothetical protein  29.71 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.012518  normal  0.12752 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08599  conserved hypothetical protein  26.46 
 
 
331 aa  63.5  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0164  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.6 
 
 
670 aa  45.8  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3554  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.3 
 
 
360 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>