16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2197 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2197  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  hitchhiker  0.00799325 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0585  hypothetical protein  65.5 
 
 		 255 aa  350  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332625  decreased coverage  0.00157125 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3377  hypothetical protein  64.34 
 
 		 259 aa  338  7e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3283  hypothetical protein  55 
 
 		 268 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3584  hypothetical protein  53.08 
 
 		 268 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462039  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3149  phytanoyl-CoA dioxygenase  53.12 
 
 		 263 aa  264  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.534046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2566  hypothetical protein  50.97 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0575  hypothetical protein  51.75 
 
 		 262 aa  239  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6645  hypothetical protein  50 
 
 		 273 aa  238  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1191  hypothetical protein  39.32 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2697  hypothetical protein  37.07 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446497  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2741  hypothetical protein  37.07 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.369564  normal  0.54067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2727  hypothetical protein  36.64 
 
 		 242 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3563  hypothetical protein  29.77 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.012518  normal  0.12752 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08599  conserved hypothetical protein  24.91 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0166  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.83 
 
 		 685 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.237009 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>