15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3584 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3584  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462039  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3283  hypothetical protein  87.59 
 
 
268 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3377  hypothetical protein  58.3 
 
 
259 aa  293  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0585  hypothetical protein  55.98 
 
 
255 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332625  decreased coverage  0.00157125 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2566  hypothetical protein  56.18 
 
 
263 aa  285  8e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2197  hypothetical protein  53.08 
 
 
258 aa  279  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  hitchhiker  0.00799325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6645  hypothetical protein  56.06 
 
 
273 aa  272  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3149  phytanoyl-CoA dioxygenase  52.77 
 
 
263 aa  257  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.534046  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0575  hypothetical protein  52.29 
 
 
262 aa  228  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1191  hypothetical protein  44 
 
 
232 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2697  hypothetical protein  43.78 
 
 
242 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446497  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2741  hypothetical protein  43.78 
 
 
242 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.369564  normal  0.54067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2727  hypothetical protein  42.92 
 
 
242 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3563  hypothetical protein  29.35 
 
 
289 aa  92  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.012518  normal  0.12752 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08599  conserved hypothetical protein  26.28 
 
 
331 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>