29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1560 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1560  tRNA CCA-pyrophosphorylase  100 
 
 
415 aa  835    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0570  tRNA CCA-pyrophosphorylase  72.25 
 
 
418 aa  639    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.07195  hitchhiker  0.00173806 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1737  tRNA CCA-pyrophosphorylase  71.77 
 
 
418 aa  612  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.672198 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1740  tRNA CCA-pyrophosphorylase  69.71 
 
 
418 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.753345  decreased coverage  0.000389887 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0998  tRNA CCA-pyrophosphorylase  44.99 
 
 
455 aa  345  7e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465929  normal  0.410879 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1784  tRNA CCA-pyrophosphorylase  38.92 
 
 
412 aa  228  1e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0562  tRNA cytidylyltransferase  35.84 
 
 
450 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.26699 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2010  CCA-adding enzyme  36.19 
 
 
412 aa  225  1e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0511  CCA-adding enzyme  34.4 
 
 
445 aa  222  9.999999999999999e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1130  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.82 
 
 
446 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0015444  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0323  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.66 
 
 
457 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0336  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.88 
 
 
462 aa  213  7e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.0285087 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1706  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.22 
 
 
460 aa  209  7e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2014  tRNA CCA-pyrophosphorylase  36.16 
 
 
454 aa  209  9e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0644301  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0675  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.97 
 
 
401 aa  209  1e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0418  CCA-adding enzyme  34.86 
 
 
494 aa  209  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0369  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.05 
 
 
464 aa  204  3e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1782  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.46 
 
 
443 aa  202  8e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0013  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.79 
 
 
465 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2208  CCA-adding enzyme  32.84 
 
 
497 aa  202  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2250  tRNA CCA-pyrophosphorylase  36.64 
 
 
450 aa  200  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.218879  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2808  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.44 
 
 
460 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0240  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.26 
 
 
446 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.788854  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0196  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.46 
 
 
444 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.79483 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1256  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.91 
 
 
464 aa  194  2e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.162335  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1706  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.71 
 
 
459 aa  193  5e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.71826  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0756  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.86 
 
 
444 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.155952  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0368  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.43 
 
 
467 aa  182  7e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.243596  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1095  hypothetical protein  28.26 
 
 
304 aa  50.4  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>