28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1256 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1256  tRNA CCA-pyrophosphorylase  100 
 
 
464 aa  929    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.162335  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0196  tRNA CCA-pyrophosphorylase  57.34 
 
 
444 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.79483 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1706  tRNA CCA-pyrophosphorylase  56.92 
 
 
459 aa  488  1e-137  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.71826  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0756  tRNA CCA-pyrophosphorylase  56.25 
 
 
444 aa  488  1e-136  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.155952  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0240  tRNA CCA-pyrophosphorylase  54.88 
 
 
446 aa  481  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.788854  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0418  CCA-adding enzyme  34.85 
 
 
494 aa  247  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2014  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.21 
 
 
454 aa  244  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0644301  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2250  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.62 
 
 
450 aa  243  7e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.218879  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2208  CCA-adding enzyme  38.1 
 
 
497 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0336  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.62 
 
 
462 aa  225  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.0285087 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0675  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.22 
 
 
401 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1130  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.36 
 
 
446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0015444  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0369  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.12 
 
 
464 aa  219  6e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2808  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.31 
 
 
460 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0562  tRNA cytidylyltransferase  31.44 
 
 
450 aa  216  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.26699 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1740  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.2 
 
 
418 aa  211  2e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.753345  decreased coverage  0.000389887 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0511  CCA-adding enzyme  35.29 
 
 
445 aa  207  3e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0013  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.23 
 
 
465 aa  207  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0570  tRNA CCA-pyrophosphorylase  36.71 
 
 
418 aa  206  7e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.07195  hitchhiker  0.00173806 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0323  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.09 
 
 
457 aa  203  5e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1706  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.45 
 
 
460 aa  203  6e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1737  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.15 
 
 
418 aa  199  7.999999999999999e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.672198 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2010  CCA-adding enzyme  34.38 
 
 
412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1560  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.91 
 
 
415 aa  195  1e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0998  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.72 
 
 
455 aa  182  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465929  normal  0.410879 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1784  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.29 
 
 
412 aa  181  2.9999999999999997e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1782  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.32 
 
 
443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0368  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.01 
 
 
467 aa  150  5e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.243596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>