28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0240 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1706  tRNA CCA-pyrophosphorylase  73.27 
 
 
459 aa  680    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.71826  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0196  tRNA CCA-pyrophosphorylase  74.07 
 
 
444 aa  676    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.79483 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0240  tRNA CCA-pyrophosphorylase  100 
 
 
446 aa  901    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.788854  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0756  tRNA CCA-pyrophosphorylase  74.07 
 
 
444 aa  678    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.155952  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1256  tRNA CCA-pyrophosphorylase  55.53 
 
 
464 aa  481  1e-134  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.162335  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0418  CCA-adding enzyme  33.72 
 
 
494 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2250  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.4 
 
 
450 aa  242  9e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.218879  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2014  tRNA CCA-pyrophosphorylase  36.58 
 
 
454 aa  238  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0644301  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2208  CCA-adding enzyme  35.59 
 
 
497 aa  231  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0511  CCA-adding enzyme  36.88 
 
 
445 aa  231  3e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0336  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.18 
 
 
462 aa  231  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.0285087 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1130  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.95 
 
 
446 aa  229  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0015444  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2808  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.38 
 
 
460 aa  228  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0562  tRNA cytidylyltransferase  34.23 
 
 
450 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.26699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0013  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.78 
 
 
465 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0369  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.89 
 
 
464 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0675  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.56 
 
 
401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0323  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.94 
 
 
457 aa  216  5e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1740  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.01 
 
 
418 aa  205  1e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.753345  decreased coverage  0.000389887 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1706  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.18 
 
 
460 aa  202  8e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0570  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.34 
 
 
418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.07195  hitchhiker  0.00173806 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1737  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.72 
 
 
418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.672198 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1560  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.26 
 
 
415 aa  197  3e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0998  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.29 
 
 
455 aa  189  1e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465929  normal  0.410879 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2010  CCA-adding enzyme  32.01 
 
 
412 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1784  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.76 
 
 
412 aa  184  4.0000000000000006e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1782  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.99 
 
 
443 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0368  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.22 
 
 
467 aa  133  5e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.243596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>