28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2014 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2014  tRNA CCA-pyrophosphorylase  100 
 
 		 454 aa  936    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0644301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1130  tRNA CCA-pyrophosphorylase  58.3 
 
 		 446 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0015444  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2808  tRNA CCA-pyrophosphorylase  44 
 
 		 460 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0323  tRNA CCA-pyrophosphorylase  42.12 
 
 		 457 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1706  tRNA CCA-pyrophosphorylase  41.33 
 
 		 460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0369  tRNA CCA-pyrophosphorylase  42.96 
 
 		 464 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0675  tRNA CCA-pyrophosphorylase  47.57 
 
 		 401 aa  333  3e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0418  CCA-adding enzyme  39.12 
 
 		 494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2250  tRNA CCA-pyrophosphorylase  41.57 
 
 		 450 aa  323  3e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.218879  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2208  CCA-adding enzyme  40.27 
 
 		 497 aa  323  5e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0013  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.72 
 
 		 465 aa  318  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0562  tRNA cytidylyltransferase  40.76 
 
 		 450 aa  311  1e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.26699 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0336  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.28 
 
 		 462 aa  298  2e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.0285087 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0511  CCA-adding enzyme  34.44 
 
 		 445 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0196  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.87 
 
 		 444 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.79483 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1256  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.21 
 
 		 464 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.162335  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1706  tRNA CCA-pyrophosphorylase  36.51 
 
 		 459 aa  243  5e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.71826  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0756  tRNA CCA-pyrophosphorylase  36.51 
 
 		 444 aa  239  8e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.155952  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0240  tRNA CCA-pyrophosphorylase  36.58 
 
 		 446 aa  238  2e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.788854  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0998  tRNA CCA-pyrophosphorylase  36.06 
 
 		 455 aa  238  2e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465929  normal  0.410879 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1740  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.97 
 
 		 418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.753345  decreased coverage  0.000389887 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0570  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.72 
 
 		 418 aa  215  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.07195  hitchhiker  0.00173806 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1560  tRNA CCA-pyrophosphorylase  36.16 
 
 		 415 aa  209  1e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2010  CCA-adding enzyme  33.51 
 
 		 412 aa  207  3e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1737  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.68 
 
 		 418 aa  205  2e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.672198 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1784  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.91 
 
 		 412 aa  183  7e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0368  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.41 
 
 		 467 aa  177  3e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.243596  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1782  tRNA CCA-pyrophosphorylase  27.88 
 
 		 443 aa  162  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>